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Python开发之实现SG滤波
Python开发之实现SG滤波
前言:主要介绍SG滤波的Python实现,顺带介绍SG滤波的实现原理。
1 SG滤波
- Savitzky-Golay滤波器(通常简称为S-G滤波器)最初由Savitzky和Golay于1964年提出,发表于Analytical Chemistry 杂志。之后被广泛地运用于数据流平滑除噪,是一种在时域内基于局域多项式最小二乘法拟合的滤波方法。这种滤波器最大的特点在于在滤除噪声的同时可以确保信号的形状、宽度不变。
- 平滑滤波是光谱分析中常用的预处理方法之一。用 Savitzky. Golay 方法进行平滑滤波,可以提高光谱的平滑性,并降低噪音的干扰。S-G 平滑滤波的效果,随着选取窗宽不同而不同,可以满足不同场合的需求。
- Savitzy-Golay 卷积平滑算法是移动平滑算法的改进。关键在于矩阵算子的求解。
更多理论介绍请查看:
《【UWB】Savitzky Golay filter SG滤波器原理讲解》
《Savitzky-Golay 滤波器》
《Savitzky-Golay平滑去噪》
《SG平滑算法(又称多项式平滑算法)》
《最小二乘法》
2 借助Python中的scipy.signal库实现SG滤波
from scipy.signal import savgol_filter
import matplotlib.pyplot as plt
def SG(data,window_size,polyorder):
smoothed_data = savgol_filter(data, window_size, polyorder).tolist()
return smoothed_data
if __name__ == '__main__':
data = [0.3962, 0.4097, 0.2956, 0.4191, 0.3456, 0.3056, 0.6346, 0.7025, 0.6568, 0.4719, 0.5645, 0.6514, 0.5717,
0.6072, 0.7076, 0.7062, 0.7086, 0.677, 0.8141, 0.7985, 0.7037, 0.7961, 0.6805, 0.5463, 0.2766]
smoothed_data = SG(data,5,2)
smoothed_data = [round(i, 4) for i in smoothed_data]#保留四位小数
smoothed_data2 = SG(data,9,3)
smoothed_data2 = [round(i, 4) for i in smoothed_data2]#保留四位小数
print("data:", data)
print("smoothed_data:", smoothed_data)
print("smoothed_data2:", smoothed_data2)
plt.plot(data, label='data')
plt.plot(smoothed_data, label='smoothed_data')
plt.plot(smoothed_data2, label='smoothed_data2')
plt.xlabel('Time')
plt.ylabel('Value')
plt.title('Line Plot')
plt.legend()
plt.show()
data: [0.3962, 0.4097, 0.2956, 0.4191, 0.3456, 0.3056, 0.6346, 0.7025, 0.6568, 0.4719, 0.5645, 0.6514, 0.5717, 0.6072, 0.7076, 0.7062, 0.7086, 0.677, 0.8141, 0.7985, 0.7037, 0.7961, 0.6805, 0.5463, 0.2766]
smoothed_data: [0.4007, 0.3779, 0.3642, 0.3621, 0.3366, 0.3884, 0.5679, 0.7173, 0.6189, 0.5319, 0.554, 0.6135, 0.6002, 0.6172, 0.6843, 0.7185, 0.688, 0.7219, 0.7803, 0.782, 0.7604, 0.746, 0.7068, 0.5433, 0.2737]
smoothed_data2: [0.4295, 0.3527, 0.326, 0.3402, 0.3864, 0.4741, 0.5428, 0.5704, 0.6193, 0.6247, 0.5715, 0.5688, 0.6023, 0.6561, 0.6591, 0.6804, 0.7305, 0.7409, 0.7562, 0.7778, 0.7894, 0.7619, 0.6805, 0.5283, 0.2882]
-注意:window_size,polyorder两个参数决定着平滑的效果,要根据自己的数据,调整合适的参数,注意不要欠拟合和过拟合。
3 手动代码实现SG滤波
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
def SG01(data,window_size):
# 前后各m个数据,共2m+1个数据,作为滑动窗口内滤波的值
m = int((window_size - 1) / 2) # (59-1) /2 = 29
# 计算 矩阵X 的值 ,就是将自变量x带进去的值算 0次方,1次方,2次方.....k-1次方,一共window_size行,k列
# 大小为(2m+1,k)
X_array = []
for i in range(window_size): #
arr = []
for j in range(3):
X0 = np.power(-m + i, j)
arr.append(X0)
X_array.append(arr)
X_array = np.mat(X_array)
# B = X*(X.T*X)^-1*X.T
B = X_array * (X_array.T * X_array).I * X_array.T
data = np.insert(data, 0, [data[0] for i in range(m)]) # 首位插入m-1个data[0]
data = np.append(data, [data[-1] for i in range(m)]) # 末尾插入m-1个data[-1]
# 取B中的第m行 进行拟合 因为是对滑动窗口中的最中间那个值进行滤波,所以只要获取那个值对应的参数就行, 固定不变
B_m = B[m]
# 存储滤波值
y_array = []
# 对扩充的data 从第m个数据开始遍历一直到(data.shape[0] - m) :(第m个数据就是原始data的第1个,(data.shape[0] - m)为原始数据的最后一个
for n in range(m, data.shape[0] - m):
y_true = data[n - m: n + m + 1] # 取出真实y值的前后各m个,一共2m+1个就是滑动窗口的大小
y_filter = np.dot(B_m, y_true) # 根据公式 y_filter = B * X 算的 X就是y_true
y_array.append(float(y_filter)) # float(y_filter) 从矩阵转为数值型
return y_array
if __name__ == '__main__':
data = [0.3962, 0.4097, 0.2956, 0.4191, 0.3456, 0.3056, 0.6346, 0.7025, 0.6568, 0.4719, 0.5645, 0.6514, 0.5717,
0.6072, 0.7076, 0.7062, 0.7086, 0.677, 0.8141, 0.7985, 0.7037, 0.7961, 0.6805, 0.5463, 0.2766]
smoothed_data = SG01(data,5)
smoothed_data = [round(i, 4) for i in smoothed_data]
smoothed_data2 = SG01(data,11)
smoothed_data2 = [round(i, 4) for i in smoothed_data2]
print("data:", data)
print("smoothed_data:", smoothed_data)
print("smoothed_data2:", smoothed_data2)
plt.plot(data, label='data')
plt.plot(smoothed_data, label='smoothed_data')
plt.plot(smoothed_data2, label='smoothed_data2')
plt.xlabel('Time')
plt.ylabel('Value')
plt.title('Line Plot')
plt.legend()
plt.show()
data: [0.3962, 0.4097, 0.2956, 0.4191, 0.3456, 0.3056, 0.6346, 0.7025, 0.6568, 0.4719, 0.5645, 0.6514, 0.5717, 0.6072, 0.7076, 0.7062, 0.7086, 0.677, 0.8141, 0.7985, 0.7037, 0.7961, 0.6805, 0.5463, 0.2766]
smoothed_data: [0.4095, 0.3663, 0.3642, 0.3621, 0.3366, 0.3884, 0.5679, 0.7173, 0.6189, 0.5319, 0.554, 0.6135, 0.6002, 0.6172, 0.6843, 0.7185, 0.688, 0.7219, 0.7803, 0.782, 0.7604, 0.746, 0.7068, 0.5015, 0.3344]
smoothed_data2: [0.3916, 0.3559, 0.3443, 0.368, 0.4265, 0.4713, 0.5107, 0.5667, 0.5903, 0.6093, 0.6122, 0.5879, 0.6034, 0.6261, 0.6685, 0.6965, 0.7121, 0.7497, 0.7714, 0.7859, 0.7623, 0.7017, 0.6148, 0.5048, 0.4128]
- 注意:效果不佳,不推荐使用。